Rastreamento Das Origens Do HIV

Rastreamento das origens do HIV

POR CHILLYMANJARO

Alfred Roca, professor assistente na Faculdade de Agricultura, Consumidor e Ciências Ambientais da Universidade de Illinois, acha que os genomas de um Oeste Africano isolado população humana fornecer pistas importantes sobre como o vírus da imunodeficiência humana (HIV) evoluiu. Novas descobertas revelam que o HIV pode ter afetado os seres humanos por muito mais tempo do que é actualmente acreditava.

HIV é pensado para ter originado a partir de chimpanzés na África Central que foram infectados com retrovírus chamado vírus da imunodeficiência símia (SIV). Ambos HIV-1 e HIV-2 são acreditados para ter originado em primatas não-humanos, em West-central África e foram transferidos para os seres humanos. Acredita-se que o HIV-1, tipo M (que responde por 90 por cento das infecções humanas) ter cruzado a barreira das espécies em populações humanas entre 1884 e 1924. Melhorias no transporte, como novas ferrovias, a urbanização ou a expansão das comunidades e cidades, além do surgimento de uma economia de fluidos globais permitiram HIV para expandir e explodir.

Roca disse que o vírus pode ter cruzado tempos muito anteriores e muitos, a seleção de resistência genética em populações rurais isoladas, permanecendo sem ser detectado. Ele disse que parte da literatura científica sugere que a persistência do HIV em humanos necessários densidade populacional típico das grandes cidades que surgiram na África Central Ocidental durante a era colonial. Antes de a medicina moderna e vacinas, doenças infecciosas como a varíola matou um grande número de pessoas. Pessoas com o sistema imunológico comprometido podem ter sucumbido primeiro, impedindo que o vírus da imunodeficiência de espalhar.

Se o HIV atravessou os tempos espécie de barreira muitos, é possível que a seleção favoreceu protecção variantes genéticas em populações afectadas.

Roca e seus co-pesquisadores procuraram por evidências de esta seleção nos genomas Biaka . O Biaka são uma comunidade humana que habita as florestas na faixa das subespécies de chimpanzés que se acredita ser a fonte da pandemia do HIV atual. Os pesquisadores compararam os genomas Biaka com os genomas de outros quatro populações africanas que vivem fora da faixa do chimpanzé.

Genótipos Biaka estavam disponíveis através do Projeto Diversidade do Genoma Humano, que recolheu amostras biológicas de 52 diferentes grupos da população em todo o mundo. O projeto genotipados essas diversas comunidades humanas para polimorfismos de nucleotídeo único ou variação genômica, em cerca de 650 mil locais em todo o genoma.

Zhao Kai, um estudante graduado que trabalha no laboratório de Roca, analisou pesquisas anteriores que as linhas celulares usadas feitas na década de 1980 a partir de indivíduos que tinham AIDS ou se acreditava estar em risco de ter identificado 26 posições genômicas como estando envolvidos na resistência ao HIV. Zhao olhou para a assinatura de seleção para uma característica genética tende a reduzir a diversidade na região genômica circundante dentro da população afetada, aumentando as diferenças entre populações. Os pesquisadores analisaram as regiões genômicas que contêm genes conhecidos por ter um efeito protetor contra o HIV para ver se havia qualquer sobreposição com as assinaturas de seleção. Oito das comparações encontrado sobreposição. Sete envolveu a Biaka. Quatro genes nestas sobreposições que codificam para proteínas que afectam quer a capacidade de HIV para infectar a célula hospedeira ou a progressão da doença foram identificados. Os pesquisadores também descobriram que, para vários genes associados com proteção contra o HIV-1 foi comum entre os Biaka. O primeiro caso bem documentado de HIV em humanos remonta a 1959, no Congo.

Roca pontos que a assinatura detectada de seleção não significa, necessariamente, que a seleção fez com que ele - é apenas um bom sinal de que a seleção pode ter ocorrido. A assinatura de selecção pode abranger vários genes, dos quais apenas um é realmente protectora contra o HIV-1. Os resultados são intrigantes e indicam que esta linha de pesquisa vale a pena perseguir. Roca disse se estudos adicionais confirmam que estes genes sofreram selecção e que as populações humanas da região ter alguma resistência genética ao HIV-1, pode-se tentar encontrar genes adicionais na população que pode também ser protetora contra o HIV, mas ainda não foram identificada.

Fontes: BMC Evolutionary Biology , Faculdade de Ciências do Consumidor, Agrícola e Ambiental da Universidade de Illinois

Alfred Roca , 217-244-8853

Imagem destaque: Micrografia eletrônica de varredura de HIV-1 de brotamento (em verde) de linfócitos culta. Esta imagem foi colorida para destacar características importantes; ver PHIL 1197 para vista preto e branco original desta imagem. Múltiplas colisões redondas sobre superfície da célula representam locais de montagem e brotamento de viriões (Crédito: C. Goldsmith / PHIL / CDC)

OS VIGILANTES http://thewatchers.adorraeli.com/2012/12/26/tracking-the-origins-of-hiv/